Les rotations sont longues (6 à 8 ans) et variées en alternant cultures d'hiver et de printemps et familles botanique différentes. Elles permettent ainsi de :
En tête de rotation, les légumineuses pluriannuelles seront fauchées plusieurs fois par an pour lutter contre les adventices et notamment les vivaces (chardons, rumex…). La dernière coupe sera préférentiellement incorporée pour augmenter la fourniture azotée. Les légumineuses représenteront 20 à 30 % de l'assolement. Chaque fois que cela est possible, la luzerne est préférable au trèfle.
En fin de rotation, il est conseillé d'intégrer des cultures peu nitrophiles et nettoyantes (tournesol, sarrasin et lin). Elles pourront également permettre l'implantation sous couvert d'une légumineuse pluriannuelle (Ex. : luzerne sous couvert de tournesol).
Une rotation bien équilibrée permet de générer une marge par hectare équivalente à une rotation conventionnelle type Colza-Blé-Orge.